学生在标准学制内有二次转专业机会。转专业工作一般安排在学期末启动，其中第一学期末可申请转入同年级其他专业就读；第二学期末可申请转入同专业群内（学校认可的，下同）其他专业就读，或转入专业群外其他专业下一级就读；其它学期末只能申请转入新专业下一级就读。
学生具备下列情形之一可以申请转专业：
（1）学生确有某种特长或对某专业具有浓厚学习兴趣，转专业之后有利于发挥所长；
（2）学生入学后因患某种疾病或生理缺陷，经学校指定医院检查证明不能在原专业学习，但尚能在本校其他专业学习的；
（3）自愿由高年级转入低年级学习的；
（4）休学创业或退役后复学的；
（5）复学或恢复入学资格时本专业（或招生类别）不再招生的；
（6）符合《江苏海事职业技术学院定向培养士官生预警、淘汰、补充管理办法》规定，需要转入或转出的；
（7）教育部、教育厅规定或经校校长办公会会研究决定的其他可以转专业情形。
学生有下列情况之一者，不允许转专业：
（1）入学未满一学期者，标准学制已完成1/2学期（不含）以后者；
（2）招生时国家或学校招生简章已有明确规定不能转专业的学生不得转专业；对口单招、艺术类、中外合作、海外本科直通车等特殊招生类型的学生不得跨类别转专业；
（3）应予退学或处于休学期间者；
（4）在校期间已有二次转专业者（含转回）；
（5）恶意拖欠学费者；
（6）教育部、教育厅规定或经校校长办公会研究决定的其他不可以转专业情形。
转专业的流程：
（1）每学期末第十八周学生自愿报名。每名学生可以填报3个专业志愿。
（2）下一学期开学第二周，由教务处统一组织，各二级学院遵循“志愿优先”模式开展录取工作，当第一志愿人数不足计划数时，在依次录取第二、第三志愿。
（3）公示结束后3个工作日内，学生到相关二级学院办理学籍变更等相关手续，正式转入新班级就读。逾期不办理转专业手续则认定为自动放弃，此后不再受理转专业申请。
（4）学生办理完转专业手续后2周内有特殊原因确需转回原专业的，经本人申请，相关二级学院同意可以转回，视为已转专业两次。